Paylaşım Yap
Tüm Reklamları Kapat
Tüm Reklamları Kapat

RaTG13: Quanto è Pericoloso un Parente Stretto di SARS-CoV-2?

RaTG13: Quanto è Pericoloso un Parente Stretto di SARS-CoV-2?
6 dakika
54
Blog Yazısı
Tüm Reklamları Kapat

Bat-CoV/RaTG13 (o precedentemente Ra4991) è un betacoronavirus simile alla SARS che infetta i pipistrelli del genere Rhinolophus affinis. È stato scoperto nel 2013 negli escrementi di pipistrelli di una vecchia miniera abbandonata nella contea di Mojiang, nello Yunnan, in Cina. RaTG13, che è stato oggetto di ricerca avviata dopo lo scoppio della pandemia COVID-19, è stato dichiarato il parente più stretto di SARS-CoV-2 con una somiglianza nucleotidica del 96,1% nel febbraio 2020. RaTG13 ha perso questo titolo quando Banal 52, scoperto in Laos/Feuang nel 2022, ha mostrato una somiglianza nucleotidica del 96,8%.

La Storia della Scoperta

Nella primavera del 2012, tre minatori nella contea di Mojiang hanno sviluppato una polmonite mortale. Quando la polmonite non ha risposto ai farmaci, i campioni prelevati dai pazienti sono stati inviati all'Istituto di virologia di Wuhan, temendo che si trattasse di una nuova malattia. Sui campioni sono stati eseguiti i test Ebola, Nipah e SARSr-Cov Rp3, quando si è verificata l'epidemia di COVID-19, sui campioni è stato eseguito anche il test SARS-CoV-2 e sono stati ottenuti risultati negativi.

Tüm Reklamları Kapat

Negli studi del 2012 e del 2015 per indagare sul possibile patogeno della malattia, sono stati prelevati campioni da pipistrelli, roditori e ratti che vivono nella miniera e nelle sue vicinanze. Sono stati isolati 284 alfacoronavirus e 9 betacoronavirus. Un ceppo del virus isolato dal personale è stato trovato nelle feci dei pipistrelli Rhinolophus affinis ed è stato inizialmente chiamato Bat-CoV/Ra4991. Dopo la pandemia di COVID-19, il nome del virus è stato modificato per essere codificato con le iniziali latine (Rhinolophus affinis), alcune lettere del luogo in cui è stato scoperto (Tongguan) e l'anno in cui è stato scoperto (2013): Bat-CoV /RaTG13.

SARS-CoV-2 (evolutivamente e geneticamente associato a RaTG13)
SARS-CoV-2 (evolutivamente e geneticamente associato a RaTG13)

Struttura e Virologia

RaTG13 è un virus a RNA a singolo filamento di polarità positiva. Ha una membrana virale a doppio strato lipidico a cui sono fissate le proteine ​​strutturali. Il genoma lungo circa 29.800 nucleotidi codifica per una proteina replicasi, 4 proteine ​​strutturali e 5 proteine ​​accessorie virali. Come tutti i coronavirus, ha 3 tipi di proteine: proteine strutturali, non strutturali e accessorie.

Tüm Reklamları Kapat

Struttura delle Proteine ​Strutturali

RaTG13; Contiene quattro diverse proteine: membrana, spike, nucleocapside e involucro:

  • Le proteine ​​di membrana codificate dal gene ORF5 sono essenziali per la replicazione virale e conferiscono al virus la sua forma rotonda. È la proteina più abbondante nel genoma ed è lunga circa 230 aminoacidi.
  • Le proteine dell'involucro codificate dal gene ORF4 sono incorporate nello strato lipidico e svolgono un ruolo in eventi come la circolazione del materiale intravirale, la formazione di vironi, il germogliamento e sono lunghe 110 aminoacidi.
  • Le proteine ​​nucleocapside codificate dal gene ORF9 (o ORF9a) subiscono la massima espressione genica e si legano all'RNA per formare strutture ribonucleoproteiche con una lunghezza media di 220 aminoacidi.
  • Le proteine ​​​​spike codificate dal gene ORF2 si legano ai recettori ACE2, interagendo tra il virus e la cellula ospite e formando l'infezione.
Glicoproteine della Spike di SARS-CoV-2 e di RaTG13
Glicoproteine della Spike di SARS-CoV-2 e di RaTG13

Meccanismo di Infezione

Anche se si presume che i coronavirus simili alla SARS utilizzino l'ACE (enzima di conversione dell'angiotensina) 2, alcuni studi indicano che l'ACE2 per RaTG13 potrebbe non essere funzionale per l'infezione. Fatta eccezione per i pipistrelli, non c'è nessun'altra creatura che RaTG13 sia abbastanza sensibile da causare un'infezione efficace. È meno sensibile agli enzimi ACE2 presenti nelle cellule umane, chiamati hACE2, rispetto a SARS-CoV-2, ma può infettare le cellule umane in casi estremi.

Le proteine ​​​​della Spike svolgono un ruolo di primo piano per un'infezione efficace nei coronavirus. Ce ne sono 74 in un coronavirus medio e le estensioni del trimero fanno sembrare il virus una corona. Questa proteina consiste di due regioni, S1 e S2, che sono state ben conservate nel processo evolutivo. La regione S1 interagisce con i recettori sulla superficie della cellula ospite durante le prime fasi dell'infezione virale. Questa regione è considerata il sito di legame del recettore (RBD). La regione S2 è responsabile della fusione della membrana tra l'involucro virale e la cellula ospite e consente al genoma virale di entrare nella cellula.

Evrim Ağacı'ndan Mesaj

Genetico

Il genoma di RaTG13, contenente circa 29.800 nucleotidi, ha una regione non tradotta chiamata 5'UTR nella regione 5' e una regione non tradotta chiamata 3'UTR nella regione 3'.

Il 5'UTR è responsabile della replicazione virale, della trascrizione e della circolazione intravirale. Ha una struttura secondaria dell'RNA evolutivamente conservata ei primi 150-200 nucleotidi sono altamente strutturati e hanno tre anse staminali conservate (SL1, SL2, SL4). Si stima che il genoma SARS-CoV-2 e RaTG13 sia costituito da 4 anse con uno stelo SL3 aggiuntivo SL1, SL2, SL3 e SL4. È presente anche una struttura più grande, SL5, contenente ORF che esprimono la proteina pp1a.

Il 3'UTR è anche responsabile di importanti attività virologiche come la replicazione virale. Il 3'UTR dei coronavirus simili alla SARS ha una media di 300-500 nucleotidi e ha una struttura secondaria dell'RNA ben conservata.

Geni dell'ORF

ORF1ab (o ORF1a/b) è comune a tutti i coronavirus ed esprime due distinti ORF (ORF1a e ORF1b) nei genomi dei virus simili alla SARS. ORF1ab, noto come gene della replicasi, codifica per le poliproteine ​​non strutturali pp1a e pp1b. Altri geni ORF possono essere elencati come segue:

  • ORF3a è un gene trovato nei coronavirus simili alla SARS. Sebbene incerto, si pensa che codifichi una proteina long helper di 275 aminoacidi coinvolta nella formazione della viroporina.
  • ORF3b si trova anche solo nei virus simili alla SARS e codifica per una breve proteina non strutturale.
  • Anche ORF3c è stato scoperto per la prima volta con SARS-CoV-2. Ma in seguito è stato scoperto anche in RaTG13 e altri SARSr-CoV. Codifica una proteina non strutturale lunga 41 aminoacidi di funzione sconosciuta.
  • ORF3d, d'altra parte, è un gene che si trova solo nei coronavirus associati a SARS-CoV-2 e RaTG13 piuttosto che in tutti i coronavirus simili alla SARS.È lungo 57 codoni e codifica una proteina non strutturale lunga 57 amminoacidi di funzione sconosciuta .
  • ORF6 codifica una proteina helper con una lunghezza media di 60 aminoacidi nei virus associati alla SARS, che varia da virus a virus.
  • ORF7a codifica per le proteine transmembrana che si pensa siano immunomodulazione e antagonismo dell'interferone, sebbene la sua funzione in RaTG13 e SARS-CoV-2 sia incerta. Anche ORF7b, che si sovrappone a ORF7a, è un gene che codifica per una proteina helper di funzione sconosciuta.
  • ORF8, che è simile a ORF7a nella struttura, codifica per la proteina helper virale denominata NS8. Questa proteina è una proteina con un dominio immunoglobulinico la cui funzione e meccanismo sono sconosciuti, che interagisce con il sistema di difesa della cellula ospite in SARS-CoV-2 e RaTG13.
  • ORF9b, precedentemente noto come ORF13, è il gene che codifica per una proteina virale regolatrice e accessoria con una lunghezza media di 90-100 aminoacidi nei coronavirus simili alla SARS.
  • ORF9b è un gene che si sovrappone alla proteina ORF9 che codifica per la proteina Nucleocapsid.
  • ORF9c (precedentemente ORF14) è un gene con una lunghezza media del codone di 70-73 in SARS-CoV-2 e RaTG13. I dati bioinformatici indicano che ORF9c potrebbe non essere un gene che codifica una proteina funzionale.
  • ORF10 è un gene lungo 38 codoni e codifica per una proteina accessoria evolutivamente non conservata. Come con ORF9c, i dati bioinformatici indicano che ORF10 potrebbe non essere un gene che codifica per una proteina virale regolatrice.

Confronto del Genoma

Il rapporto di somiglianza genetica tra RaTG13 e SARS-CoV-2 è mostrato nella tabella sottostante.

Tüm Reklamları Kapat

Evoluzione, Tassonomia e Filogenetica

In termini tassonomici, RaTG13 appartiene alla classe dei Sarbecovirus, che fa parte della sottofamiglia dei Betacoronavirus della famiglia dei Coronavirus, scientificamente chiamata Orthocoronavirinae. Appartiene al clade dei virus associati a SARS-CoV-2 all'interno di Sarbecovirus.

L'evoluzione del RaTG13

Non esiste una relazione ancestrale-discendente tra SARS-CoV-2 e RaTG13 (cioè uno non si è evoluto direttamente dall'altro). L'evoluzione di entrambi i virus non è ancora chiara; tuttavia, una caratteristica distintiva dei coronavirus simili alla SARS è la tendenza alla ricombinazione genetica con altri coronavirus nell'organismo ospite che infettano. L'evoluzione dei SARSr-CoV, che si è discostata e si è evoluta molto presto dal resto dei betacoronavirus, è unica. Mentre questi passi evolutivi sono prevedibili, non sono chiari per RaTG13 e SARS-CoV-2. Sono in fase di studio questioni come quando si è evoluto l'antenato comune dei due virus e l'ospite intermedio di SARS-CoV-2. Un metodo di misurazione prevede che la divergenza dei due virus dal loro antenato comune possa variare da 18 a 71,4 anni. Secondo questa previsione, è prevista anche l'esistenza di altri SARSr-CoV che sono più simili a RaTG13 che a SARS-CoV-2 e che si sono discostati dall'antenato comune in un periodo precedente.

Alıntı Yap
Okundu Olarak İşaretle
3
Paylaş
Sonra Oku
Notlarım
Yazdır / PDF Olarak Kaydet
Bize Ulaş
Yukarı Zıpla

Bu blog yazısıyla ilgili bir sorunuz mu var? Buraya tıklayarak sorabilirsiniz.

Soru & Cevap Platformuna Git
Bu İçerik Size Ne Hissettirdi?
  • Grrr... *@$# 1
  • Muhteşem! 0
  • Tebrikler! 0
  • Bilim Budur! 0
  • Mmm... Çok sapyoseksüel! 0
  • Güldürdü 0
  • İnanılmaz 0
  • Umut Verici! 0
  • Merak Uyandırıcı! 0
  • Üzücü! 0
  • İğrenç! 0
  • Korkutucu! 0
Tüm Reklamları Kapat

Evrim Ağacı'na her ay sadece 1 kahve ısmarlayarak destek olmak ister misiniz?

Şu iki siteden birini kullanarak şimdi destek olabilirsiniz:

kreosus.com/evrimagaci | patreon.com/evrimagaci

Çıktı Bilgisi: Bu sayfa, Evrim Ağacı yazdırma aracı kullanılarak 31/05/2023 05:45:12 tarihinde oluşturulmuştur. Evrim Ağacı'ndaki içeriklerin tamamı, birden fazla editör tarafından, durmaksızın elden geçirilmekte, güncellenmekte ve geliştirilmektedir. Dolayısıyla bu çıktının alındığı tarihten sonra yapılan güncellemeleri görmek ve bu içeriğin en güncel halini okumak için lütfen şu adrese gidiniz: https://evrimagaci.org/s/14678

İçerik Kullanım İzinleri: Evrim Ağacı'ndaki yazılı içerikler orijinallerine hiçbir şekilde dokunulmadığı müddetçe izin alınmaksızın paylaşılabilir, kopyalanabilir, yapıştırılabilir, çoğaltılabilir, basılabilir, dağıtılabilir, yayılabilir, alıntılanabilir. Ancak bu içeriklerin hiçbiri izin alınmaksızın değiştirilemez ve değiştirilmiş halleri Evrim Ağacı'na aitmiş gibi sunulamaz. Benzer şekilde, içeriklerin hiçbiri, söz konusu içeriğin açıkça belirtilmiş yazarlarından ve Evrim Ağacı'ndan başkasına aitmiş gibi sunulamaz. Bu sayfa izin alınmaksızın düzenlenemez, Evrim Ağacı logosu, yazar/editör bilgileri ve içeriğin diğer kısımları izin alınmaksızın değiştirilemez veya kaldırılamaz.

Tüm Reklamları Kapat
Keşfet
Akış
İçerikler
Gündem
İnsan Türü
Biyokimya
Cinsiyet
Yumurtalık
Viral Enfeksiyon
Araç
Mikoloji
Büyük Patlama
Veri Bilimi
Yavru
Video
Eğitim
Damar
Obezite
Savaş
Felsefe
Arkeoloji
Entropi
Gıda
Kişilik
Koaservat
Doktor
Film
Moleküler Biyoloji
Evrenin Genişlemesi
Aklımdan Geçen
Komünite Seç
Aklımdan Geçen
Fark Ettim ki...
Bugün Öğrendim ki...
İşe Yarar İpucu
Bilim Haberleri
Hikaye Fikri
Video Konu Önerisi
Başlık
Gündem
Bugün Türkiye'de bilime ve bilim okuryazarlığına neler katacaksın?
Bağlantı
Kurallar
Komünite Kuralları
Bu komünite, aklınızdan geçen düşünceleri Evrim Ağacı ailesiyle paylaşabilmeniz içindir. Yapacağınız paylaşımlar Evrim Ağacı'nın kurallarına tabidir. Ayrıca bu komünitenin ek kurallarına da uymanız gerekmektedir.
1
Bilim kimliğinizi önceleyin.
Evrim Ağacı bir bilim platformudur. Dolayısıyla aklınızdan geçen her şeyden ziyade, bilim veya yaşamla ilgili olabilecek düşüncelerinizle ilgileniyoruz.
2
Propaganda ve baskı amaçlı kullanmayın.
Herkesin aklından her şey geçebilir; fakat bu platformun amacı, insanların belli ideolojiler için propaganda yapmaları veya başkaları üzerinde baskı kurma amacıyla geliştirilmemiştir. Paylaştığınız fikirlerin değer kattığından emin olun.
3
Gerilim yaratmayın.
Gerilim, tersleme, tahrik, taciz, alay, dedikodu, trollük, vurdumduymazlık, duyarsızlık, ırkçılık, bağnazlık, nefret söylemi, azınlıklara saldırı, fanatizm, holiganlık, sloganlar yasaktır.
4
Değer katın; hassas konulardan ve öznel yoruma açık alanlardan uzak durun.
Bu komünitenin amacı okurlara hayatla ilgili keyifli farkındalıklar yaşatabilmektir. Din, politika, spor, aktüel konular gibi anlık tepkilere neden olabilecek konulardaki tespitlerden kaçının. Ayrıca aklınızdan geçenlerin Türkiye’deki bilim komünitesine değer katması beklenmektedir.
5
Cevap hakkı doğurmayın.
Bu platformda cevap veya yorum sistemi bulunmamaktadır. Dolayısıyla aklınızdan geçenlerin, tespit edilebilir kişilere cevap hakkı doğurmadığından emin olun.
Gönder
Ekle
Soru Sor
Sosyal
Yeniler
Daha Fazla İçerik Göster
Evrim Ağacı'na Destek Ol
Evrim Ağacı'nın %100 okur destekli bir bilim platformu olduğunu biliyor muydunuz? Evrim Ağacı'nın maddi destekçileri arasına katılarak Türkiye'de bilimin yayılmasına güç katmak için hemen buraya tıklayın.
Popüler Yazılar
30 gün
90 gün
1 yıl
EA Akademi
Evrim Ağacı Akademi (ya da kısaca EA Akademi), 2010 yılından beri ürettiğimiz makalelerden oluşan ve kendi kendinizi bilimin çeşitli dallarında eğitebileceğiniz bir çevirim içi eğitim girişimi! Evrim Ağacı Akademi'yi buraya tıklayarak görebilirsiniz. Daha fazla bilgi için buraya tıklayın.
Etkinlik & İlan
Bilim ile ilgili bir etkinlik mi düzenliyorsunuz? Yoksa bilim insanlarını veya bilimseverleri ilgilendiren bir iş, staj, çalıştay, makale çağrısı vb. bir duyurunuz mu var? Etkinlik & İlan Platformumuzda paylaşın, milyonlarca bilimsevere ulaşsın.
Youtube
Umut: Her Şey Çok Güzel Olacak mı?
Umut: Her Şey Çok Güzel Olacak mı?
Araba Tekerleği Yuvarlak Olmak Zorunda mı? Üçgen Tekerlek Mümkün mü?
Araba Tekerleği Yuvarlak Olmak Zorunda mı? Üçgen Tekerlek Mümkün mü?
Bazen Kalbinize Bıçak Saplanmış Gibi Bir Ağrı Hissediyor musunuz?
Bazen Kalbinize Bıçak Saplanmış Gibi Bir Ağrı Hissediyor musunuz?
Bir Diyetin Zırva Olup Olmadığını Nasıl Anlarız?
Bir Diyetin Zırva Olup Olmadığını Nasıl Anlarız?
Yazın Cereyanda (Soğuk Hava Akıntısında) Kalmak Sizi Hasta Eder mi?
Yazın Cereyanda (Soğuk Hava Akıntısında) Kalmak Sizi Hasta Eder mi?
Podcast
Evrim Ağacı'nın birçok içeriğinin profesyonel ses sanatçıları tarafından seslendirildiğini biliyor muydunuz? Bunların hepsini Podcast Platformumuzda dinleyebilirsiniz. Ayrıca Spotify, iTunes, Google Podcast ve YouTube bağlantılarını da bir arada bulabilirsiniz.
Yazı Geçmişi
Okuma Geçmişi
Notlarım
İlerleme Durumunu Güncelle
Okudum
Sonra Oku
Not Ekle
Kaldığım Yeri İşaretle
Göz Attım

Evrim Ağacı tarafından otomatik olarak takip edilen işlemleri istediğin zaman durdurabilirsin.
[Site ayalarına git...]

Filtrele
Listele
Bu yazıdaki hareketlerin
Devamını Göster
Filtrele
Listele
Tüm Okuma Geçmişin
Devamını Göster
0/10000
Alıntı Yap
Evrim Ağacı Formatı
APA7
MLA9
Chicago
I. Ay. RaTG13: Quanto è Pericoloso un Parente Stretto di SARS-CoV-2?. (25 Mayıs 2023). Alındığı Tarih: 31 Mayıs 2023. Alındığı Yer: https://evrimagaci.org/s/14678
Ay, I. (2023, May 25). RaTG13: Quanto è Pericoloso un Parente Stretto di SARS-CoV-2?. Evrim Ağacı. Retrieved May 31, 2023. from https://evrimagaci.org/s/14678
I. Ay. “RaTG13: Quanto è Pericoloso un Parente Stretto di SARS-CoV-2?.” Edited by . Evrim Ağacı, 25 May. 2023, https://evrimagaci.org/s/14678.
Ay, Ilgaz. “RaTG13: Quanto è Pericoloso un Parente Stretto di SARS-CoV-2?.” Edited by . Evrim Ağacı, May 25, 2023. https://evrimagaci.org/s/14678.
Geri Bildirim Gönder
ve seni takip ediyor
Evrim Ağacı Uygulamasını
İndir
Chromium Tabanlı Mobil Tarayıcılar (Chrome, Edge, Brave vb.)
İlk birkaç girişinizde zaten tarayıcınız size uygulamamızı indirmeyi önerecek. Önerideki tuşa tıklayarak uygulamamızı kurabilirsiniz. Bu öneriyi, yukarıdaki videoda görebilirsiniz. Eğer bu öneri artık gözükmüyorsa, Ayarlar/Seçenekler (⋮) ikonuna tıklayıp, Uygulamayı Yükle seçeneğini kullanabilirsiniz.
Chromium Tabanlı Masaüstü Tarayıcılar (Chrome, Edge, Brave vb.)
Yeni uygulamamızı kurmak için tarayıcı çubuğundaki kurulum tuşuna tıklayın. "Yükle" (Install) tuşuna basarak kurulumu tamamlayın. Dilerseniz, Evrim Ağacı İleri Web Uygulaması'nı görev çubuğunuza sabitleyin. Uygulama logosuna sağ tıklayıp, "Görev Çubuğuna Sabitle" seçeneğine tıklayabilirsiniz. Eğer bu seçenek gözükmüyorsa, tarayıcının Ayarlar/Seçenekler (⋮) ikonuna tıklayıp, Uygulamayı Yükle seçeneğini kullanabilirsiniz.
Safari Mobil Uygulama
Sırasıyla Paylaş -> Ana Ekrana Ekle -> Ekle tuşlarına basarak yeni mobil uygulamamızı kurabilirsiniz. Bu basamakları görmek için yukarıdaki videoyu izleyebilirsiniz.

Daha fazla bilgi almak için tıklayın

Önizleme
Görseli Kaydet
Sıfırla
Vazgeç
Ara

Göster

Şifremi unuttum Üyelik Aktivasyonu

Göster

Şifrenizi mi unuttunuz? Lütfen e-posta adresinizi giriniz. E-posta adresinize şifrenizi sıfırlamak için bir bağlantı gönderilecektir.

Geri dön

Eğer aktivasyon kodunu almadıysanız lütfen e-posta adresinizi giriniz. Üyeliğinizi aktive etmek için e-posta adresinize bir bağlantı gönderilecektir.

Geri dön

Close