PCR'da bulunan Taq polimeraz termofilik arke bakteriden alınmadır. Taq enziminin(Klentaq), E.coli DNA Polimeraz (Klenow) 'dan daha stabilize halde olması yüksek ısıya karşı dayanıklılık sağlar. Enzimlerin yapılarına baktığımızda Taq enziminde glisin daha fazla, bu glisin fazlalılığı glisinin yapısı gereği stabiliteyi artırır çünkü katlanmadan glisini koparmak için daha çok enerji gerekir. Ayrıca enzimin yapısında non-kovalent etkileşimler ve hidrojen bağları fazladır. Ayrıca Taq enziminin katlanma entalpisi yani harcadığı enerji Klenow'un katlanma entalpisinden daha azdır yani Taq daha az entropiktir bu yüzden stabildir. Bu entropikliğin az olması E. coli Pol I'in denatüre halinin, Taq'ninkinden daha genişletilmiş olmasıdır. Ya da diğer bir deyişle Taq katlanırken daha fazla su molekülü salar etrafa bu da daha çökmüş bir yapı oluşturarak entropiyi azaltır.
Özetlemek gerekirse;
- Glisin gibi amino asit farklılıkları
- Katlanırken ortama fazla su vermesi ve çökmüş olması
- Bolca non-kovalent ve hidrojen bağları içermesi
- Katlanma entalpisinin DNA Pol I 'den daha az olması
Bunların hepsi daha az entropik olmasına yani protein stabilitesinin fazla olmasına bu da ısıya karşı dayanıklı olmasını sağlar.
Kaynaktan daha ayrıntılı bilgi edinebilirsin.
Kaynaklar
- S.J. Ganesan. Biochemistry: Why Is Taq Polymerase So Thermostable?. (16 Kasım 2020). Alındığı Tarih: 16 Kasım 2020. Alındığı Yer: | Arşiv Bağlantısı