Ruhun epifiz bezi aracılığıyla bedenle etkileşime geçtiği tezinin mimarı Fransız filozof Rene Descartes idi. Böyle düşünmesinin ana nedeni diğer bölgelerin aksine epifiz bezinin beynin yaklaşık olarak ortada bulunması ve bir tane olması. Diğer bölgeler her iki beyin lobunda da simetrik bir şekilde bulunuyor gibi göründüğü için ve Descartes ruhun tek ve bölünmez bir töz olduğunu düşündüğü için beyinle ruhun etkileştiği yer olarak beynin merkezi denebilecek yerde bir tane bulunan bezi seçti. Descartes ruhun 'hayvan ruhları' (animal spirits) dediği şeyler aracılığıyla epifiz bezini itip çekerek hareket ettirdiğini ve bunun da bedenin hareketine yol açtığını düşünüyordu. Bu bize tuhaf gelebilir. Ama Descartes mekanik bir doğa anlayışına sahipti. Doğadaki etkileşimlerin tamamen itme/çekme cinsinden olduğunu düşünmek anlamında Newton öncesi olsa da Newtonvari bir evren anlayışına sahipti. Bu yüzden ruhun edeni hareket ettirmesini de itme çekme cinsinden açıklıyordu. Ama o zamanın mekanik nedensellik anlayışı yer kaplamayan ruhun bedeni nasıl hareket ettirdiğini açıklamıyordu. Sonuçta mekanik nedensellik anlayışı uzayda hareket eden cisimlerin birbirleriyle etkileşimine dayanmaktaydı. Ruh böyle bir cisim olmadığından ruhun epifiz bezini nasıl hareket ettirdiği de Descartes'ın sisteminde muallakta kalır. Etkileşim problemi olarak bilinen bu problem Descartes'ın felsefesine belki de en öldürücü darbeyi vurmuştu ve modern felsefede ilk olarak onun ders verdiği Bohemya prensesi Elizabeth tarafından ortaya atılmıştı.
Ancak günümüzde ruhun varlığını savunan Richard Swinburne ve J.P. Moreland gibi filozoflar ruh ve beden arasındaki nedensel ilişkinin Descartes'ın bahsettiği türden itme-çekme gibi etkileşimlerden kaynaklandığını kabul etmemekte. Bu fikir Descartes'ın beyinle ilgili bilgilerinin ve kendi felsefi sisteminin sonucunda vardığı, günümüzde geçerliliği olmayan bir fikir. Epifiz bezi özel olarak bedenin hareket ettirilmesiyle ilgili olmadığı gibi, ruhla ilişkilendirilen akıllı/bilinçli süreçlerle de diğer beyin bölgelerine kıyasla daha fazla ilgisi yok. Dolayısıyla ruh varsa özel olarak epifiz beziyle bağlantısı olduğunu kabul etmemiz için hiçbir nedenimiz yok.
