Evet. Senin hesabın doğru ama maalesef fizikte çok kafa karışmasın diye detaylar genelde gizlenir. O yüzden bu soruyu cevaplamak için detaya gitmemiz gerekecek.

Senin hesabına göre protonun kütlesi :

2u Kuark (4.4 MeV/c²) + 1d Kuark (4.7 MeV/c²) = 9.1 MeV/c²

Hesabın doğru ama bu parçacıkların Higgs alanı ile etkileşimi sonucu olan kütleleridir. Gerçekte bu değer protonun kütlesinin %1'ine denk gelir. Protonun geriye kalan kütlesi kuarkların kinetik enerjileri ve gluonların enerjilerinin toplamıdır (Enerjinin, kütle eşleniği ile hesap ediliyor).

Protonun kütlesi 938 MeV/C² dir. Elektron kütlesi 0.51 MeV/C² Oranlarsak 938/ 0.51 = yaklaşık 1836 eder. Yani protonun kütlesi, elektronun kütlesinden yaklaşık 1836 kat daha büyüktür. Buradaki^[1] yazıdan çok daha detaylı hesabını okuyabilirsin.

Çok güzel bir soru. Merakını hiç kaybetme :)