Fotosentez ve fotofosforilasyon birbirine bağlı ama aynı şey değildir. Aralarındaki ilişki şöyle:
Fotosentez, bitkilerin, alglerin ve bazı bakterilerin ışık enerjisini kullanarak karbondioksit ve suyu glikoza (besin) dönüştürdüğü genel süreçtir. Yani fotosentez, ışık reaksiyonları ve karanlık reaksiyonları (Calvin döngüsü) kapsayan geniş bir biyokimyasal olaydır.
Fotofosforilasyon ise fotosentezin ışık reaksiyonları sırasında gerçekleşen bir alt süreçtir. Burada ışık enerjisi kullanılarak ADP’ye fosfat grubu eklenip ATP (enerji molekülü) sentezlenir. Yani fotofosforilasyon, ATP üretimini sağlayan özel bir kimyasal olaydır.
Özet:
Fotosentez, enerji dönüşümünü ve organik madde yapımını kapsayan geniş bir süreç.
Fotofosforilasyon ise bu sürecin ışık reaksiyonlarında ATP üretimini sağlayan kısmı.
Yani fotofosforilasyon, fotosentezin bir parçası veya çeşididir.