Aşının amacı bireyi çok hasta etmeden olabildiğince çok sonradan bağışıklık kazanmasını sağlamaktan geçer. İlk doz aşı olduğumuz zaman vücudumuz birincil bağışıklık tepkisini veriyor fakat bağışıklık sitemi daha önce hiç SARS-CoV-2 antijeni ile karşılaşmadığından çok tepki veremiyor. Fakat ikinci doz yapıldığı zaman ikincil bağışıklık tepkisi oluşuyor ve bu sefer bağışıklık sistemi virüs antijeni ile önceden karşılaştığı için daha hızlı kuvvetli tepki veriyor.
O yüzden ikici dozunun birinci doza göre daha şiddetli tepkileri var ki Biontech 3. faz çalışması yayınında bile bu konu üzerinde kısaca durulmuştu.