Hakan Mutlu Ankara'da doğdu. İlkokul birinci sınıfı Özbekistan'da okuduktan sonra ilk, orta ve lise öğrenimini Ankara'da tamamladı. 2011 senesinde Ankara Üniversitesi Dil ve Tarih - Coğrafya Fakültesi Antropoloji Bölümü'nden mezun oldu. Aynı sene Almanya'daki Eberhard Karls Universität Tübingen'de yüksek lisansa başladı. 2014 senesinde buradaki Doğa Bilimleri Arkeolojisi Enstitüsü'nün (Institut für Naturwissenschaftliche Archäologie) Paleoantropoloji bilim dalından mezun olarak Master of Science (M.Sc.) ünvanını almaya hak kazandı. Yine 2014'te, mezun olduğu Dil ve Tarih - Coğrafya Fakültesi'nin Antropoloji Bölümü'ndeki Paleoantropoloji Anabilim Dalı'nda araştırma görevlisi kadrosuna atandı ve sene sonunda Ankara Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Paleoantropoloji Bilim Dalı'nda doktora programına başladı. Hâlen doktora eğitimine devam eden Hakan Mutlu insanın evrimsel geçmişi, biyouzaklık çalışmaları ve Üst Paleolitik Dönem bilişsel evrimi konuları üzerine çalışmalar yapıyor. Akademik ilgi alanları dışında ise müziğe, seslendirme sanatçılığına, video oyunlarına ve yemek yemeye ise özel bir ilgi duyuyor.