SARS-CoV-2'nin genomu lineer, pozitif yönlü, tek şeritli RNA'dan oluşmaktadır ve bu RNA, yaklaşık 30.000 baz uzunluğundadır.[1] Genounda sitozin (C) ve guanin (G) nükleotitlerine yönelik negatif bir önyargı vardır; yani genomda bu iki nükleotit, adenin (A) ve urasil (U) nükleotitlerinden daha seyrek bulunur - ki bu, diğer koronavirüslerde de görülen bir durumdur.[2] Genomun %32.2'sini urasil, %29.9'unu adenin, %19.6'sını guanin, %18.3'ünü sitozin oluşturmaktadır.[3]
Bu nükleotit asimetrisi, virüsün, sitozin ve guanini urasil ve adenine dönüştüren mutasyonlara daha açık olmasından kaynaklanmaktadır.[4] Bu açıklığın sebebi ise, SARS-CoV-2 virüsünün, hücrelerimizde bulunan çinko parmak antiviral proteini ile ilişkili savunma sistemini atlatmak üzere evrimleşmiş olmasıdır.[5] Buna ek olarak, bu genom konfigürasyonu, replikasyon (çoklanma) ve translasyon sırasında daha düşük kopma enerjisine ihtiyaç duymaktadır; çünkü adenozin ve urasil baz çifti 2 hidrojen bağına, sitozin ve guanin ise 3 hidrojen bağına sahiptir.[6]
Kaynaklar
- P. V’kovski. (2021). Coronavirus Biology And Replication: Implications For Sars-Cov-2. Nature Reviews Microbiology, sf: 155-170. doi: 10.1038/s41579-020-00468-6. | Arşiv Bağlantısı
- M. Kandeel, et al. (2020). From Sars And Mers Covs To Sars-Cov-2: Moving Toward More Biased Codon Usage In Viral Structural And Nonstructural Genes. Journal of Medical Virology, sf: 660-666. doi: 10.1002/jmv.25754. | Arşiv Bağlantısı
- W. Hou. (2020). Characterization Of Codon Usage Pattern In Sars-Cov-2. Virology Journal, sf: 1-10. doi: 10.1186/s12985-020-01395-x. | Arşiv Bağlantısı
- Y. Wang, et al. (2020). Human Sars-Cov-2 Has Evolved To Reduce Cg Dinucleotide In Its Open Reading Frames. Scientific Reports, sf: 1-10. doi: 10.1038/s41598-020-69342-y. | Arşiv Bağlantısı
- A. M. Rice, et al. (2021). Evidence For Strong Mutation Bias Toward, And Selection Against, U Content In Sars-Cov-2: Implications For Vaccine Design. Molecular Biology and Evolution, sf: 67-83. doi: 10.1093/molbev/msaa188. | Arşiv Bağlantısı
- Y. Wang, et al. (2020). Human Sars-Cov-2 Has Evolved To Reduce Cg Dinucleotide In Its Open Reading Frames. Scientific Reports, sf: 1-10. doi: 10.1038/s41598-020-69342-y. | Arşiv Bağlantısı
