Dolly’nin klonlanmasında çekirdeği kullanılan koyunun yumurta hücresi kullanılmadı, çünkü bu yöntem başarılı olmuyordu. Daha önce yapılan denemelerde, aynı koyundan alınan çekirdek ve yumurta hücresi ile klonlama yapmaya çalışıldığında, embriyoların gelişimi duruyordu veya anormal doğumlar meydana geliyordu. Bu nedenle, bilim insanları farklı koyunlardan alınan çekirdek ve yumurta hücresi ile klonlama yapmayı denediler ve bu şekilde Dolly’yi üretmeyi başardılar.

Bir taşıyıcı koyun kullanmak yerine kopyalanacak koyunun çekirdeği kendi yumurta hücresine koyulup kopyalanacak koyuna transfer edilmedi, çünkü bu yöntem teknik olarak çok zor ve riskliydi. Kopyalanacak koyunun yumurta hücresini almak için onu ameliyat etmek gerekirdi. Ayrıca, yumurta hücresinin içindeki çekirdeği çıkarmak ve yerine başka bir çekirdek koymak çok hassas bir işlemdi. Bu işlem sırasında yumurta hücresinin zarar görmesi veya bozulması ihtimali vardı. Bu nedenle, bilim insanları daha kolay ve güvenli olan bir yöntem seçtiler. Taşıyıcı koyundan alınan yumurta hücresinin içindeki çekirdeği çıkardılar ve yerine kopyalanacak koyundan alınan bir meme bezi hücresinin çekirdeğini yerleştirdiler. Böylece, taşıyıcı koyunun rahmine yerleştirilen embriyo, kopyalanacak koyunun genetik materyalini taşıyordu.