"İklim Mühendisliği" Uygulamaları tam olarak gelişmiş olmadığından böyle bir durumun yaşanması şu an için çok zor, fakat eğer bu sistem geliştirilirse ve kullanılmaya başlanırsa bu tür sorunlar ile karşılaşabiliriz:
Ekosistemin bozulması: İnsanların bu tür doğa olaylarına müdahale etmesi doğanın ekolojik dengesini değiştirebilir. Bu durum bitki ve hayvanlara zarar verecektir.
Tehlikeler: Bu teknolojinin kullanılması öngörülemez sonuçlar doğurabilir. Örneğin, hava kirliliği seviyelerinin yükselmesi, ozon tabakasının bozulması, sıcaklık artışı, hatta sağlık sorunları gibi etkiler ortaya çıkabilir.
Politik Amaçlar: İklim mühendisliği uygulamaları, karar vericilerin politik amaçlarına hizmet edebilir. Bu durum, hava olayları ve iklim üzerinde müdahalede bulunulmasının tarafsız ve etik değerlendirilmesini engelleyebilir.