Evrim Ağacı, 5 Kasım 2010'da Orta Doğu Teknik Üniversitesi Biyoloji Bölümü'nde, Biyoloji ve Genetik Topluluğu altında bir öğrenci grubu olarak kuruldu. Kurucuları arasında Çağrı Mert Bakırcı, Babür Erdem, Güngör Budak ve diğer biyoloji bölümü öğrencileri bulunuyordu. Grubun amacı, evrimsel biyoloji konularını önce kendi aralarında öğrenmek, sonrasında diğer öğrencilere öğretmek ve halk arasında konuyla ilgili yanlış bilgileri düzeltmekti.