17. yüzyıl astronomu Giovanni Domenico Cassini, Jüpiter'in Büyük Kırmızı Lekesi'ni dikkatle izleyen keskin bir gözlemciydi. Bu yüzden, onun adını taşıyan Cassini uzay aracının, gezegen boyutlarında bir başka kusurun ayrıntılı gözlemlerini mümkün kılması çok yerinde görünüyor: Jüpiter'in Büyük Karanlık Lekesi. Kırmızı Leke'nin aksine, Büyük Karanlık Leke Jüpiter'in kuzey kutbuna yakın bir konumda. Yüzlerce yıl boyunca kalıcı olmak yerine, aylar ölçeğinde ortaya çıkıp kayboluyor gibi görünüyor. Morötesi dalga boylarında bakıldığında bu karanlık yapı, kutbu çevreleyen rüzgârların sınırladığı Jüpiter stratosferinde yer alıyor. Bu durum, Dünya'daki Antarktika ozon deliğine benzerlik gösteriyor. Buradaki Karanlık Leke görüntüsü, uzay aracının 2000 yılındaki Jüpiter yakın geçişi sırasında kaydedilen verilerle oluşturulan bir filmin tek bir karesidir. Jüpiter'in kuzey kutup bölgesini gösterecek biçimde projeksiyon yapıldığından, ortadaki boş görünen alan için veri yoktur. Büyük Karanlık Leke ise merkezin üstünde ve biraz solunda yer alır. Beyaz çember 60 derece enlemi işaret eder. Mavi kontur ise, Büyük Karanlık Leke'nin oluşumuyla bağlantılı olabilecek kalıcı bir Jüpiter kutup ışıkları (aurora) kuşağını çevreler.