Bulunan fosiller nasıl üç boyutlu modellenebiliyor?

Elbette ki fenotipi tam olarak yansıtmaz; ancak morfolojiyi (dış görünüşü) büyük oranda yansıtır. Çünkü morfolojiyi belirleyen parametreler zaten başlıca kemikler ve o kemiklere tutunan kaslardır. Hal böyle olunca herhangi bir canlının kemiklerinden, o canlının kabaca neye benzediğini anlayabiliyoruz. Çünkü kemiklerin şekillerini de kemiklere tutunan kaslar verir. Bütün canlıların ortak atadan türleştiği hesaba katılınca, omurgalılardaki kas yapısı aynıdır. Sadece çeşitlenmiştir, bu yüzden aynı kasların farklı şekilleri tespit edilmelidir. Zira bu konuda karşılaştırmalı anatomi diye güçlü bir bilim dalı var.

Fakat canlının yumuşak dokuları (tüyleri, derisi, çıkıntıları) diğer akrabaları ile karşılaştırılarak tutarlı bir şekilde tahmin edilmeye çalışılır. Tabii yumuşak dokusu bulunduğu için renkleri vs. bilinen fosiller de yok değil. Ancak her zaman bu kadar şanslı olunmuyor. Bahsettiğiniz soruya en güzel örnek Spinosaurus cinsi mesela. Çünkü 2014 yılına kadar, Tyrannosaurus gibi bipedal bir tür olduğu düşünülüyordu, hatta Jurassic Park 3 filminde bile öyle modellendi. Fakat yapılan ileri analizler, aslında 4 ayak üzerinde yürümeye daha yatkın olduğunu gösterdi. Sonuçta biraz epik ve ağırlık merkezi önde yeniden modellendi. Dolayısıyla fenotip biraz değişti, ancak morfoloji büyük oranda aynı.