Klomipraminin metabolizması öncelikle karaciğerde CYP450 2D6 ile oksidasyon yoluyla gerçekleşir. Klomipraminin yarılanma ömrü 17 ila 28 saattir. Klomipramin daha sonra CYP450 1A2 tarafından kararlı durum aktif metaboliti desmetil klomipramine metabolize edilir.
32 görüntülenme